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蛋白序列比对

clustal x 可以做全序列比对 如果要做进化树 再用MEGA4.0

序列不同但颜色相同表示虽然有不同的氨基酸,但是它们属于同一类,结构和功能很相似,有可能不影响蛋白整体效果;上方星号表示很保守,所有序列在这个位置的氨基酸都一样;点号表示比较保守,虽然有不同的氨基酸但是是同类(序列不同颜色相同)...

当然是多序列对比,保守性衡量的是同源基因在整个进化树中的变化程度...而不是两个物种之间的差异.

图呢 图呢。。。

因为首先密码子是兼容性的,有的氨基酸对应的密码子有三到四个,所以核酸序列不一样的情况下,氨基酸序列也有可能是一样的,而且直接决定性状的是蛋白质,所以比较蛋白质的氨基酸序列更有效

tblastn:蛋白序列对核算库的比对,将库中的核酸序列翻译成蛋白序列,然后进行比对。tblastx:核酸序列对核算库在蛋白级别的比对,将库和待查序列都翻译成蛋白序列,然后对...

你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序列都是编码链的序列。

序列比对[1] 是生物信息学[2] 的基本组成和重要基矗序列比对的基本思想是,基于生物学中序列决定结构,结构决定功能的普遍规律,将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串,检测序列之间的相似性,发现生物序列中的功能...

不太明白你想问什么。用vector NTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了。 若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点。

这个图案是用DNAman,是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件,几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作,包换多重序列对齐、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。你下一个绿化版的软件,对了都是...

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