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蛋白序列比对

序列不同但颜色相同表示虽然有不同的氨基酸,但是它们属于同一类,结构和功能很相似,有可能不影响蛋白整体效果;上方星号表示很保守,所有序列在这个位置的氨基酸都一样;点号表示比较保守,虽然有不同的氨基酸但是是同类(序列不同颜色相同)...

因为首先密码子是兼容性的,有的氨基酸对应的密码子有三到四个,所以核酸序列不一样的情况下,氨基酸序列也有可能是一样的,而且直接决定性状的是蛋白质,所以比较蛋白质的氨基酸序列更有效

图呢 图呢。。。

t_coffee,能够翻译 DNA 序列为蛋白质序列,比对后,再根据蛋白质序列的比对结果,产生 DNA 比对结果。 不过是命令行操作。 vectornt 好像只能多序列比对,不能翻译 可以试试 {来源网络搜素}

不太明白你想问什么。用vector NTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了。 若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点。

因为首先密码子是兼容性的,有的氨基酸对应的密码子有三到四个,所以核酸序列不一样的情况下,氨基酸序列也有可能是一样的,而且直接决定性状的是蛋白质,所以比较蛋白质的氨基酸序列更有效

同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变, 需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因.。 我你可以参考一下这个http://wenku.baidu.com/link?url=G-zoZmJzxR57EXH1OUu_dRpf1Brs-LWMJl1hNGYTIT4VU-4CY_hoiEGpYYXNROXc_udd_xOR21Zo4J...

Blast的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据库称为database,里面的每一条序列称为subject),然后用待查序列(query)在database中搜索,每一条query与...

t_coffee,能够翻译 DNA 序列为蛋白质序列,比对后,再根据蛋白质序列的比对结果,产生 DNA 比对结果。 不过是命令行操作。 vectornt 好像只能多序列比对,不能翻译 可以试试 {来源网络搜素}

是要 similarity?? clustal x 可以做全序列比对 如果要做进化树 再用MEGA4.0

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